Biological Data Management Using Relational Database Systems
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Beschreibung
Das rasche Wachstum wissenschaftlicher Daten birgt erhebliche Herausforderungen für Forschende, da es Programmierkenntnisse und Zugriff auf moderne Hardware erfordert. Daher sind gut strukturierte relationale Datenbanken für moderne wissenschaftliche Studien essentiell. Die Herausforderungen einer Studie zu vorgelagerten offenen Leserastern (uORFs) in Krebspatienten veranschaulichten die Notwendigkeit einer zentralen uORF-Datenbank, um groß angelegte Studien zu ermöglichen. Daher wurde die ehemalige Literaturdatenbank uORFdb um Sequenzen von uORFs und mögliche mit Krebs assoziierte Mutationen erweitert. In einem zweiten Projekt wurde MetagenomicsDB entwickelt, um das Datenmanagement einzelner longitudinaler Mikrobiomstudien zu fördern. Das System stellt die Integrität der gesammelten Daten im Mehrbenutzerbetrieb sicher und fördert deren Auswertung. Beide Datenbanken benötigen für ihre Nutzung keine tiefgreifenden bioinformatischen Kenntnisse und tragen dadurch dazu bei, wissenschaftliche Analysen allen Forschenden zugänglich zu machen.
Autor*in
Felix Manske
Themen in »Biological Data Management Using Relational Database Systems«
Datenbank vorgelagertes offenes Leseraster Translationskontrolle Krebs Mikrobiom Darm Neugeborene Database upstream open reading frame translational control cancer microbiome gut newborn