Detection of pathogenic infections in neurological disorders through recycling of gene expression data
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Beschreibung
In dieser Arbeit wurde eine Online-Plattform für small RNA entwickelt, die die Analyse der Sequenzierungsdaten von über 4.000 weltweit gewonnenen Proben verschiedener Organismen homogenisiert. Mit ihr wurden gewebe- und krankheitsspezifische Biomarker gefunden, sowie Hinweise auf bakterielle und virale Infektionen der sequenzierten Gewebe. Dies motivierte die Entwicklung eines Algorithmus für die Analyse von Nicht-Wirts-RNA-Sequenzierungsdaten zum Detektieren von Pathogenen. Bei einer Fokussierung auf neurologische Erkrankungen wurde bakterielle Präsenz im Gehirn von Demenzpatienten detektiert. Die Plattform und der Algorithmus können der Wissenschaft behilflich sein, neue Studien mit wichtigen Informationen zu verbessern.
Autor*in
Anna-Maria Liebhoff
Themen in »Detection of pathogenic infections in neurological disorders through recycling of gene expression data«
Algorithm development Alzheimer Analyse-Pipelines Bakterien Bioinformatics Bioinformatik Biologische Ontologien Blut-Hirn-Schranke Burkholderia Stabilis Data Science Data recycling Datenbanksystem Datenintegration Datenwissenschaft Erreger