Bioinformatik
Methoden zur Vorhersage von RNA- und Proteinstrukturen
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Beschreibung
Mit Hilfe der Bioinformatik können ermittelte DNA-, RNA- oder
Aminosäuresequenzen hinsichtlich Struktur und Funktion schnell
eingeschätzt werden; das spart Kosten und Zeit bei weiterführenden
Experimenten im Labor.
Das vorliegende Buch gliedert sich in einen RNA- und einen Protein-Teil.
Je ein Kapitel führt das biologische Thema der Strukturvorhersage
inklusive biophysikalischer Grundlagen der Vorhersagemethoden ein.
Folgekapitel gehen auf die informationstechnischen Methoden mit einem
möglichst kurzen Beispiel ein, stellen den meist komplizierteren
Algorithmus zur Lösung des biologischen Problems vor und diskutieren zum
Abschluss mindestens eine Implementation und damit erzielbare Ergebnisse
anhand eines biologischen Beispiels.
Das Buch ist gleichermassen für Biologen und Informatiker relevant, da
es sowohl einen Überblick über die aktuellen Möglichkeiten der
Strukturvorhersage gibt als auch den Einsatz von unterschiedlichsten
informationstechnischen Methoden in der Biologie demonstriert.
Übersicht über aktuelle Bioinformatik-Methoden anhand konkreter biologischer Themen Der Autor leitet eine Biocomputing-Arbeitsgruppe an der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf Grundlage des Buches ist der Stoff der Bioinformatik II Vorlesung des Autors Ausführliches Literaturverzeichnis Index zu besprochenen Programmen
Mit Hilfe der Bioinformatik lassen sich Struktur und Funktion von DNA-, RNA- oder Aminosäuresequenzen am Computer schnell einschätzen. Damit können viele teure und zeitaufwendige Experimente im Labor vermieden oder eingeschränkt werden.
Das Buch gliedert sich in einen RNA- und einen Protein-Teil. Das biologische Thema der Strukturvorhersage inklusive biophysikalischer Grundlagen der Vorhersage-Methoden wird eingeführt. Es folgen die informationstechnischen Methoden mit einem möglichst kurzen, meist fachfremden Beispiel. Dann stellt das Buch den meist komplizierteren Algorithmus zur Lösung des biologischen Problems vor und diskutiert abschließend an einem biologischen Beispiel mindestens eine Implementation mit Ergebnis.
Autor*in
Gerhard Steger
Themen in »Bioinformatik«
Algorithmen Aminosäure Bioinformatik Biologie Informationstheorie Nukleinsäure Proteine Proteinstruktur RNA Sekundärstruktur Säure Proteomics