Bioinformatik

Beschreibung

Locker und leicht verständlich geschrieben führt dieser Leitfaden in die Grundlagen und Möglichkeiten der Sequenzanalyse ein.

Das Buch beginnt mit einer Einführung in die wichtigen Sequenzdatendatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die wachsende Zahl der Motivdatenbanken. Anschließend werden die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments beschrieben sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST). Multiple Alignments, Substitutionsmatrizen und die Berechnung phylogenetischer Bäume werden dem Leser nahe gebracht. Neu hinzugekommen sind auch Erläuterungen der Prinzipien der Genomanalyse und der gängigsten Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools im Internet oder freie Software angegeben.

Das Buch richtet sich an Anwender und Einsteiger in die Bioinformatik, speziell Studenten und Forscher, die sich mit der Sequenzanalyse auseinandersetzen müssen.

Wie berechnet man multiple Alignments? Wie nutzt man eine Datenbank, um die im Labor ermittelten Sequenzen effektiv zu analysieren? Locker und leicht verständlich führt der Leitfaden in die Geheimnisse der Bioinformatik ein. Schwerpunkt sind die Grundlagen und verschiedenen Möglichkeiten der Sequenzanalyse.
Am Anfang steht eine Einführung in die wichtigen Sequenzdatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die Motivdatenbanken. Die Autorin beschreibt die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments und erklärt die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST).

Autor*in

Andrea Hansen

Themen in »Bioinformatik«

Algorithmen BLAST-Algorithmus Bioinformatik Datenbanken Genom Genvorhersage phylogenetische Analysen Proteomics

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Das Buch deckt alle Aspekte der Sequenzbearbeitung und –verarbeitung ab und macht es so zu einem Standardwerk der Bioinformatik. (BIOspektrum)

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